藏区阜康医院门诊全称是藏区阜康医院妇产少年儿童院区，创办于2009年7月7日，已经发展为一家集医疗设备、健康保健、科学研究、课堂教学为一体的三级甲等妇产科儿科医院。配有妇产科、中医妇科、妇产科、小儿科、产科、NICU、幼儿保健、仿真模拟待产室、病理科、病理科、急诊科、超声诊断(B超)、PCR试验室、生物学试验室、机构标本库等临床医学卫技科学研究部门。

协助生殖中心是藏区阜康医院特色科室，于2015年9月3日通过国家卫生和计划生育联合会专家团审查及青海省卫生计生委准许，得到进行人类辅助生殖技术性相关资质，变成青海省唯一一家可以进行人类辅助生殖科技的核心。

藏区阜康医院门诊生殖中心占地面积2300平米，各自设有病人诊室；不孕不育症男、女科诊断室；B超室；妇科体检室；生长激素诊断室；男科病试验室；促排卵室；移殖室；IUI诊室；IUI精夜解决试验室；IVF精夜解决室；试管胚胎试验室；胚胎冷冻室、妇产科诊室、妇科病房及其温暖高档的家中医院病房等，以适应各种不孕不育症病人的医治必须。

藏区阜康妇产儿童医院生殖中心发展历程：

2016年3月2日，在成都锦江妇幼保健医院的协助下，藏区阜康医院门诊第一例试管婴儿成功怀孕；2016年9月24日，第一例藏区做试管婴儿在拉萨阜康医院取得成功问世，这例试管婴儿的取得成功，弥补了藏区试管婴儿的空缺；2017年1月25日，藏区阜康试管婴儿医院临床医学周期时间123例，冷冻周期率81.2％，取得成功怀孕 17例，已孕妇分娩8例。